研究内容

研究内容の紹介です。

プロフィール写真

セリンプロテアーゼKLK8(neuropsin)の基質特異性の機構

セリンプロテアーゼKLK8は中枢神経系で発現し、統合失調症、認知症などの精神疾患との関連性が報告されています。本研究室ではKLK8の基質特異性を決定する4つの因子を提案し、速度論的実験結果との直接比較によりその有効性を報告してきました。さらにこのマーモセット脳内の精神・神経疾患に関わる遺伝子発現データベースとのリンクにより、KLK8の基質の一つであるNeuregulin-1(NRG1)の特異的切断部位の配列の特異性について報告しました。さらに金属の添加、糖鎖修飾による活性、特異性変化について分子動力学シミュレーションと量子化学計算を組み合わせた研究を進めています。 

                                  Lintuluoto, M., Horioka, Y., Fujiwara, M., Abe, M., Fukunishi, Y., Tamura, H., & Lintuluoto, J. M. (2025). Investigation on the Substrate Specificity of Serine Protease Neuropsin by Molecular Dynamics Simulation and Marmoset Gene Atlas (MGA). ACS omega. Lintuluoto, M., Abe, M., Horioka, Y., Fukunishi, Y., Tamura, H., & Lintuluoto, J. M. (2022). Investigation on substrate specificity and catalytic activity of serine protease neuropsin. Biophysics and Physicobiology, 19, e190040.
プロフィール写真

2量体間タンパク質間のシグナル・情報伝達機構の解明

2量体間のタンパク質間のシグナル・情報伝達機構を長時間分子動力学シミュレーション、ネットワーク解析から、分子レベルでの解明を目指しています。

プロフィール写真

シュウ酸カルシウムの凝集過程におけるペプチドの影響

尿結石の主成分であるシュウ酸カルシウムの凝集過程にペプチドがどのように関係しているのか、リン酸化や糖化の影響について、分子動力学計算及び量子化学計算を用いた研究を行っています。

プロフィール写真

実験科学と計算科学の融合を目指してー金属タンパク質における反応機構解析ー

Cuを含有するタンパク質、亜硝酸還元酵素(CuNiR)やazurinなどにおけるプロトン移動や電子移動機構について、X線結晶構造解析、中性子回折などの実験科学グループとともに量子化学計算を用いて研究を進めています。

Fukuda, Y., Lintuluoto, M., Hirano, Y., Kusaka, K., Inoue, T., & Tamada, T. (2025). Structural basis of cuproenzyme nitrite reduction at the level of a single hydrogen atom. Journal of Biological Chemistry, 301(7). Fukuda, Y., Lintuluoto, M., Kurihara, K., Hasegawa, K., Inoue, T., & Tamada, T. (2024). Overlooked Hydrogen Bond in a Blue Copper Protein Uncovered by Neutron and Sub-Ångström Resolution X-ray Crystallography. Biochemistry, 63(3), 339-347.

そのほかにも。。。 

  • SOD1,SOD3の変異と構造変化、疾患との関連性
  • ヒアルロン酸へのCD44の動的結合認識
  • 膜タンパク質の分子認識と構造変化、シグナリングに関する研究
  • 補酵素結合によるアロステリック構造変化機構の解明
  •                  

    「少々遠回りでも、一歩ずつ進めていきます」